MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 4258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003065	AT	3	6	8	13	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003065	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003065	ATT	2	6	155	160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003065	GAT	2	6	176	181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003065	GT	4	8	182	189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003065	ATT	2	6	227	232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003065	TA	3	6	263	268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003065	AT	3	6	274	279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003065	TAT	2	6	284	289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003065	TA	3	6	303	308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003065	GATA	3	12	329	340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003065	TAA	2	6	379	384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003065	GTG	2	6	435	440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41223314
14	NC_003065	GCT	2	6	529	534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223314
15	NC_003065	TTG	2	6	674	679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41223314
16	NC_003065	ATA	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41223314
17	NC_003065	GCG	2	6	754	759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41223314
18	NC_003065	GCT	2	6	809	814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223314
19	NC_003065	ATCGA	2	10	874	883	40 %	20 %	20 %	20 %	41223314
20	NC_003065	GCC	2	6	894	899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223314
21	NC_003065	GATC	2	8	932	939	25 %	25 %	25 %	25 %	41223314
22	NC_003065	CGC	2	6	1049	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223314
23	NC_003065	CGG	2	6	1108	1113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41223314
24	NC_003065	AAG	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41223314
25	NC_003065	GAT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41223314
26	NC_003065	CTG	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223314
27	NC_003065	CAGT	2	8	1448	1455	25 %	25 %	25 %	25 %	41223314
28	NC_003065	AAG	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003065	AGCA	2	8	1558	1565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_003065	CTG	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_003065	A	7	7	1666	1672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003065	AGAA	2	8	1707	1714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003065	GT	3	6	1749	1754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003065	AGG	2	6	1780	1785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003065	AAGAC	2	10	1875	1884	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_003065	TCA	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_003065	T	6	6	1955	1960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003065	CTT	2	6	2036	2041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_003065	GCC	2	6	2051	2056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_003065	TA	3	6	2069	2074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003065	GAT	2	6	2150	2155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003065	AGA	2	6	2164	2169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003065	TAT	2	6	2191	2196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003065	ATT	2	6	2217	2222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003065	ATT	3	9	2236	2244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003065	TAT	2	6	2282	2287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003065	CG	3	6	2323	2328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_003065	TAC	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119814
49	NC_003065	GAA	2	6	2476	2481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119814
50	NC_003065	TGA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119814
51	NC_003065	ATGT	2	8	2665	2672	25 %	50 %	25 %	0 %	16119814
52	NC_003065	GTG	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119814
53	NC_003065	GA	3	6	2784	2789	50 %	0 %	50 %	0 %	16119814
54	NC_003065	TG	3	6	2818	2823	0 %	50 %	50 %	0 %	16119814
55	NC_003065	GAA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119814
56	NC_003065	GAA	2	6	2910	2915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119814
57	NC_003065	TGC	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119814
58	NC_003065	TG	3	6	2974	2979	0 %	50 %	50 %	0 %	16119814
59	NC_003065	GGGC	2	8	2980	2987	0 %	0 %	75 %	25 %	16119814
60	NC_003065	TTGT	2	8	3027	3034	0 %	75 %	25 %	0 %	16119814
61	NC_003065	AT	3	6	3135	3140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003065	TAAA	2	8	3187	3194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003065	TTTAT	2	10	3244	3253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003065	ATGAG	2	10	3308	3317	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003065	TAA	2	6	3404	3409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003065	TG	3	6	3450	3455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003065	GGT	2	6	3470	3475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003065	T	7	7	3475	3481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003065	CAA	2	6	3518	3523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_003065	GAG	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161953
71	NC_003065	AATG	2	8	3638	3645	50 %	25 %	25 %	0 %	159161953
72	NC_003065	T	6	6	3669	3674	0 %	100 %	0 %	0 %	159161953
73	NC_003065	CGG	2	6	3734	3739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161953
74	NC_003065	GCC	2	6	3829	3834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161953
75	NC_003065	AG	3	6	3870	3875	50 %	0 %	50 %	0 %	159161953
76	NC_003065	GCCA	2	8	3885	3892	25 %	0 %	25 %	50 %	159161953
77	NC_003065	CTA	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161953
78	NC_003065	TCG	2	6	3949	3954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161953
79	NC_003065	TTGT	2	8	4002	4009	0 %	75 %	25 %	0 %	159161953
80	NC_003065	GAT	2	6	4068	4073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161953
81	NC_003065	AAGA	2	8	4150	4157	75 %	0 %	25 %	0 %	159161953
82	NC_003065	TAA	2	6	4164	4169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159161953
83	NC_003065	TTC	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161953
84	NC_003065	TCC	2	6	4317	4322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159161953
85	NC_003065	GCG	2	6	4348	4353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161953
86	NC_003065	ACCA	2	8	4501	4508	50 %	0 %	0 %	50 %	159161953
87	NC_003065	GC	3	6	4586	4591	0 %	0 %	50 %	50 %	159161953
88	NC_003065	CTT	2	6	4613	4618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161953
89	NC_003065	CGT	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161953
90	NC_003065	GC	3	6	4671	4676	0 %	0 %	50 %	50 %	159161953
91	NC_003065	TCA	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161953
92	NC_003065	TGC	2	6	4809	4814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161953
93	NC_003065	GCTG	2	8	4849	4856	0 %	25 %	50 %	25 %	159161953
94	NC_003065	CTG	2	6	4875	4880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161953
95	NC_003065	ATG	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161953
96	NC_003065	TCT	2	6	4906	4911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161953
97	NC_003065	CTT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161953
98	NC_003065	TCC	2	6	4992	4997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159161953
99	NC_003065	AAG	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161953
100	NC_003065	GGA	2	6	5012	5017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161953
101	NC_003065	GGAG	2	8	5030	5037	25 %	0 %	75 %	0 %	159161953
102	NC_003065	GCT	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161953
103	NC_003065	CTTT	2	8	5058	5065	0 %	75 %	0 %	25 %	159161953
104	NC_003065	TTA	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003065	AGC	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_003065	GTT	2	6	5250	5255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003065	T	7	7	5254	5260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003065	GAAA	2	8	5285	5292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003065	TAA	2	6	5307	5312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003065	ACG	2	6	5335	5340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_003065	TTG	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003065	AAAGG	2	10	5451	5460	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003065	TGAAAT	2	12	5495	5506	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003065	AG	3	6	5680	5685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003065	CCAAC	2	10	5704	5713	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_003065	CAG	2	6	5744	5749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_003065	TTG	2	6	5769	5774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003065	ATG	2	6	5864	5869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003065	TCG	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_003065	CTTT	2	8	6067	6074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_003065	GAT	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119816
122	NC_003065	GAA	2	6	6238	6243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119816
123	NC_003065	CAG	2	6	6247	6252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119816
124	NC_003065	GCG	2	6	6262	6267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119816
125	NC_003065	GC	3	6	6369	6374	0 %	0 %	50 %	50 %	16119816
126	NC_003065	GCA	2	6	6404	6409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119816
127	NC_003065	CCAG	2	8	6423	6430	25 %	0 %	25 %	50 %	16119816
128	NC_003065	ATCTAC	2	12	6457	6468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119816
129	NC_003065	TAT	2	6	6482	6487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119816
130	NC_003065	TCA	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119816
131	NC_003065	CCA	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119816
132	NC_003065	CAG	2	6	6575	6580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119816
133	NC_003065	GCT	2	6	6644	6649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119816
134	NC_003065	CAC	2	6	6699	6704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119816
135	NC_003065	GTG	2	6	6707	6712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119816
136	NC_003065	GGA	2	6	6717	6722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119816
137	NC_003065	AGAGA	2	10	6742	6751	60 %	0 %	40 %	0 %	16119816
138	NC_003065	TCG	2	6	6773	6778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119816
139	NC_003065	AAC	2	6	6895	6900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_003065	AAT	2	6	7008	7013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003065	TAT	2	6	7062	7067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003065	T	7	7	7120	7126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003065	TGG	2	6	7277	7282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159162007
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260	NC_003065	AGGC	2	8	13248	13255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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263	NC_003065	TGAT	2	8	13360	13367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
264	NC_003065	ATT	2	6	13410	13415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_003065	GT	3	6	14150	14155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
280	NC_003065	ATA	2	6	14214	14219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_003065	TGT	2	6	14279	14284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_003065	TTG	2	6	14286	14291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_003065	ATT	2	6	14311	14316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_003065	AT	4	8	14325	14332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_003065	TATTC	2	10	14475	14484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_003065	GAA	2	6	14555	14560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_003065	TTA	2	6	14601	14606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_003065	GTGGC	2	10	14615	14624	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
289	NC_003065	AGGA	2	8	14651	14658	50 %	0 %	50 %	0 %	16119822
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294	NC_003065	TGC	2	6	14798	14803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119822
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323	NC_003065	TTGA	2	8	16208	16215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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325	NC_003065	A	6	6	16248	16253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_003065	CAT	2	6	20159	20164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_003065	CTT	2	6	20195	20200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_003065	ATA	2	6	20214	20219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_003065	TAGATA	2	12	20245	20256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
404	NC_003065	TTC	2	6	20311	20316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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406	NC_003065	T	6	6	20353	20358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_003065	ATT	2	6	20410	20415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_003065	TTTCT	2	10	20542	20551	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_003065	CAT	2	6	20706	20711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119825
413	NC_003065	GATT	2	8	20807	20814	25 %	50 %	25 %	0 %	16119825
414	NC_003065	ACG	2	6	20818	20823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119825
415	NC_003065	GGT	2	6	20893	20898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119825
416	NC_003065	CAG	2	6	20910	20915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119825
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422	NC_003065	CAT	2	6	21181	21186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_003065	TAT	3	9	21205	21213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_003065	GTT	2	6	21357	21362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_003065	ATG	2	6	21460	21465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_003065	GGT	2	6	21466	21471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_003065	TATT	2	8	21515	21522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_003065	TTA	2	6	21595	21600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_003065	TCCGC	2	10	21694	21703	0 %	20 %	20 %	60 %	16119826
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453	NC_003065	GCC	3	9	22682	22690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
454	NC_003065	GAG	2	6	22702	22707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
455	NC_003065	G	6	6	22716	22721	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
456	NC_003065	CAG	2	6	22726	22731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
457	NC_003065	CAG	2	6	22791	22796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_003065	GTT	2	6	22883	22888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_003065	GC	3	6	23005	23010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
462	NC_003065	ATAA	2	8	23077	23084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_003065	ATT	2	6	23104	23109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_003065	AT	3	6	24819	24824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_003065	AAT	2	6	24861	24866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_003065	ACC	2	6	24983	24988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159161954
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